在Ubuntu中，FileZilla支持以下文件传输协议：

1. FTP（文件传输协议）：用于在客户端和服务器之间传输文件，但不提供加密。
2. FTPS（FTP over SSL/TLS）：FTP的安全版本，通过SSL/TLS加密数据传输。
3. SFTP（SSH文件传输协议）：基于SSH协议提供安全的文件传输。

FileZilla是一款免费、开源的跨平台FTP客户端软件，适用于多种操作系统，包括Windows、Linux和Mac OS X。它提供了直观的图形用户界面和强大的文件传输功能，支持多协议传输，包括FTP、FTPS和SFTP，确保了数据传输的安全性和可靠性。无论是在个人用户还是企业用户之间，FileZilla都能高效地管理和传输文件。